Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUSP9Q99956 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP9Q99956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms