Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A3Q99624 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A3Q99624 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC38A3Q99624 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms