Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CRBNQ96SW2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms