Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC6Q96NY7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC6Q96NY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms