Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms