Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC10A4Q96EP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms