Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC126Q96EE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC126Q96EE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms