Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN23Q96B33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN23Q96B33 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms