Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VTI1AQ96AJ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1AQ96AJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms