Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1MTQ969P6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms