Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RHBDD1Q8TEB9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD1Q8TEB9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms