Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF39Q86UA1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms