Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNKQ7Z7G1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLNKQ7Z7G1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLNKQ7Z7G1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms