Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA0408Q6ZU52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA0408Q6ZU52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms