Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms