Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMFQ6X4W1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms