Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms