Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF549Q6P9A3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF549Q6P9A3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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