Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDE2Q6IQ49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms