Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNS3Q68CZ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNS3Q68CZ2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNS3Q68CZ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms