Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
C9orf84Q5VXU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
C9orf84Q5VXU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
C9orf84Q5VXU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms