Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC122Q5T0U0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms