Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCID2Q5JVF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCID2Q5JVF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms