Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
FRMPD3Q5JV73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FRMPD3Q5JV73 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD3Q5JV73 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms