Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GREB1Q4ZG55 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms