Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syndig1lQ3USQ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms