Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDRF1Q3B7T1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDRF1Q3B7T1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms