Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK4Q16654 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK4Q16654 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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