Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGISQ16647 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGISQ16647 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms