Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMGN3Q15651 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGN3Q15651 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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