Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC41Q15345 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms