Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1I3Q14994 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1I3Q14994 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms