Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMA1Q12791 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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