Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 IFM1YOL023W 2031 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ATG31YDR022C 591 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 NAT2YGR147C 867 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 NCA3YJL116C 1014 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 MET14YKL001C 609 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 IMP2YMR035W 534 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ESA1YOR244W 1338 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 BRN1YBL097W 2265 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 OST1YJL002C 1431 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 KTR5YNL029C 1569 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 VHT1YGR065C 1782 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 RIM1YCR028C-A 408 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YDR269CYDR269C 324 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 EFM4YIL064W 774 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 DAL3YIR032C 588 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YJR087WYJR087W 351 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 NNT1YLR285W 786 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YML6YML025C 861 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 HLJ1YMR161W 675 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPQ1YOL092W 927 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SFM1YOR021C 642 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SLF1YDR515W 1344 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 EMP46YLR080W 1335 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 HXK2YGL253W 1461 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 UGA2YBR006W 1494 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 EKI1YDR147W 1605 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 MKK1YOR231W 1527 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ASA1YPR085C 1332 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YDL057WYDL057W 987 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 PPM1YDR435C 987 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 GUK1YDR454C 564 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YGR210CYGR210C 1236 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YHR125WYHR125W 306 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SQT1YIR012W 1296 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YLR462WYLR462W 609 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YNL337WYNL337W 255 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 PEP12YOR036W 867 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPL088WYPL088W 1029 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPR202WYPR202W 717 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPK2YMR104C 2034 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SUC2YIL162W 1599 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ACA1YER045C 1470 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SEC4YFL005W 648 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 RPL16AYIL133C 600 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ECM19YLR390W 339 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 COQ3YOL096C 939 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 OPY1YBR129C 987 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPT10YBR264C 600 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 PFK2YMR205C 2880 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 DAL4YIR028W 1908 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 RCM1YNL022C 1473 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 CLB1YGR108W 1416 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 DAS1YJL149W 1992 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 BUD27YFL023W 2391 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 PSA1YDL055C 1086 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 THI4YGR144W 981 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YIL025CYIL025C 375 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 FUN14YAL008W 597 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 CMC2YBL059C-A 330 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YNL043CYNL043C 321 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 TOM22YNL131W 459 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ATG8YBL078C 354 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YPL108WYPL108W 507 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SVS1YPL163C 783 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YBR062CYBR062C 543 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 BMT2YBR141C 1014 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 MSA1YOR066W 1890 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 BDP1YNL039W 1785 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 THI20YOL055C 1656 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YCL075WYCL075W 441 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SKP1YDR328C 585 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 Q0092Q0092 141 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 HIS1YER055C 894 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 RPS20YHL015W 366 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YIL161WYIL161W 708 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YJL064WYJL064W 396 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 PRM10YJL108C 1152 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 UBI4YLL039C 1146 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SUA7YPR086W 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 snR3snR3 194 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YMR155WYMR155W 1644 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YML020WYML020W 1995 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 GPA1YHR005C 1419 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 SMF1YOL122C 1728 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YJL049WYJL049W 1353 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 NUS1YDL193W 1128 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 DAD1YDR016C 285 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 QCR8YJL166W 285 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 KAE1YKR038C 1161 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 UBX4YMR067C 1251 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-DR3Q12441 RRN9YMR270C 1098 nt5.82□□□□□ -1.48
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