Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CPSF1Q10570 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPSF1Q10570 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
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