Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCBP1Q09161 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms