Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLFN5Q08AF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLFN5Q08AF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms