Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F3Q08477 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms