Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PSME1Q06323 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms