Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMX2Q04743 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms