Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 ORC6YHR118C 1308 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 MRS2YOR334W 1413 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 CAB3YKL088W 1716 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 CRD1YDL142C 852 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YGL132WYGL132W 336 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 BCY1YIL033C 1251 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 CKA1YIL035C 1119 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 MRP17YKL003C 396 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 LDB18YLL049W 540 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 HMX1YLR205C 954 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 ATG38YLR211C 681 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 HAP3YBL021C 435 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 WRS1YOL097C 1299 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YPL062WYPL062W 405 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 COX11YPL132W 903 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 HUT1YPL244C 1020 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 ENT1YDL161W 1365 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 RCM1YNL022C 1473 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 MEF2YJL102W 2460 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 MIG1YGL035C 1515 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 NGL3YML118W 1518 nt5.23□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 VID30YGL227W 2877 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 HFA1YMR207C 6372 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 WHI2YOR043W 1461 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 PRO2YOR323C 1371 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 KNH1YDL049C 807 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 SNU23YDL098C 585 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 NUS1YDL193W 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 MLC1YGL106W 450 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 RPS2YGL123W 765 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 PUS6YGR169C 1215 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 PRP21YJL203W 843 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YAR069CYAR069C 294 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 PFK27YOL136C 1194 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 YOR338WYOR338W 1092 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 CIN2YPL241C 807 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 FDH2YPL275W 711 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 RAD24YER173W 1980 nt5.22□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 QDR1YIL120W 1692 nt5.21□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 GZF3YJL110C 1656 nt5.21□□□□□ -1.57
SRP1Q02821 SHM1YBR263W 1473 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YCL068CYCL068C 783 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 ARP2YDL029W 1176 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PDS1YDR113C 1122 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TLG1YDR468C 675 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 FOL2YGR267C 732 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SAM37YMR060C 984 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SYC1YOR179C 567 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 FIG1YBR040W 897 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 OXR1YPL196W 822 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YCL007CYCL007C 393 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TRE2YOR256C 2430 nt5.21□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YDL012CYDL012C 324 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RUB1YDR139C 234 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 COBQ0105 1158 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YGL193CYGL193C 312 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YHR173CYHR173C 339 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PPX1YHR201C 1194 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PAN6YIL145C 930 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 GLG2YJL137C 1143 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YJU3YKL094W 942 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TVP38YKR088C 1014 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YNR062CYNR062C 984 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SNF8YPL002C 702 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YPR114WYPR114W 948 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SEC12YNR026C 1416 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TDA3YHR009C 1572 nt5.2□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 IKS1YJL057C 2004 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 KKQ8YKL168C 2175 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 MDL1YLR188W 2088 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YIL001WYIL001W 1542 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RPL35BYDL136W 363 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PEX18YHR160C 852 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SVP26YHR181W 687 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SWD2YKL018W 990 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YKL202WYKL202W 582 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YMR085WYMR085W 1299 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RUF22RUF22 515 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 UAF30YOR295W 687 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 UBC11YOR339C 471 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RAD16YBR114W 2373 nt5.19□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SYG1YIL047C 2709 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 GPB1YOR371C 2694 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 snR56snR56 88 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms