Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 CAF16YFL028C 870 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 SEC53YFL045C 765 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 GRE3YHR104W 984 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RPS4BYHR203C 786 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RPS4AYJR145C 786 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YLR428CYLR428C 345 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MRPL3YMR024W 1173 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 IBD2YNL164C 1056 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MVD1YNR043W 1191 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YPR003CYPR003C 2265 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 THI22YPR121W 1719 nt3.56□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MCM7YBR202W 2538 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 ALO1YML086C 1581 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RIM4YHL024W 2142 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YNR065CYNR065C 3351 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RGP1YDR137W 1992 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 PRP11YDL043C 801 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MMM1YLL006W 1281 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YLR122CYLR122C 378 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 REX4YOL080C 870 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 KIP3YGL216W 2418 nt3.55□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RAD57YDR004W 1383 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 BDP1YNL039W 1785 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MET17YLR303W 1335 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YCR050CYCR050C 309 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YER134CYER134C 537 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 AIM21YIR003W 2040 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 GPI10YGL142C 1851 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 OSH3YHR073W 2991 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 MMR1YLR190W 1476 nt3.54□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 APE2YKL157W 2859 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 TMA17YDL110C 453 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YDL228CYDL228C 642 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YDR526CYDR526C 471 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 COX2Q0250 756 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 PIR3YKL163W 978 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 YPR059CYPR059C 387 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 RAD26YJR035W 3258 nt3.53□□□□□ -1.84
NUP49Q02199 VPS36YLR417W 1701 nt3.53□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 GGA1YDR358W 1674 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 TAF6YGL112C 1551 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 PIC2YER053C 903 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 ELF1YKL160W 438 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YLL017WYLL017W 312 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 PFA4YOL003C 1137 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YOR342CYOR342C 960 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YBR225WYBR225W 2703 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YRM1YOR172W 2361 nt3.52□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YER085CYER085C 522 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 RRT7YLL030C 342 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 EOS1YNL080C 1101 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 FDH1YOR388C 1131 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 NAT3YPR131C 588 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 APL4YPR029C 2499 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 GEM1YAL048C 1989 nt3.51□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 PEP7YDR323C 1548 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 EMC1YCL045C 2283 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 SLM5YCR024C 1479 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 NUS1YDL193W 1128 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 BNA1YJR025C 534 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YGK3YOL128C 1128 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 IDH2YOR136W 1110 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 MAL13YGR288W 1422 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 FAR8YMR029C 1572 nt3.5□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 HST1YOL068C 1512 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 UIP3YAR027W 708 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YBL010CYBL010C 843 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YPT7YML001W 627 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 ARG80YMR042W 534 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YBR134WYBR134W 402 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 KRE29YER038C 1395 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 MAD3YJL013C 1548 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YLR345WYLR345W 1530 nt3.49□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 SOF1YLL011W 1470 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 ASI1YMR119W 1875 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 IOC2YLR095C 2439 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YDL183CYDL183C 963 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 MRPL11YDL202W 750 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 OSW1YOR255W 837 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 MRPS9YBR146W 837 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 USA1YML029W 2517 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 ROD1YOR018W 2514 nt3.48□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 PHO87YCR037C 2772 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 TAF1YGR274C 3201 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YGR051CYGR051C 324 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 AUR1YKL004W 1206 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 YOL035CYOL035C 303 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 SPN1YPR133C 1233 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 SWI1YPL016W 3945 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 ERG5YMR015C 1617 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 MNT4YNR059W 1743 nt3.47□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 HPR1YDR138W 2259 nt3.46□□□□□ -1.85
NUP49Q02199 DHH1YDL160C 1521 nt3.46□□□□□ -1.86
NUP49Q02199 ARO9YHR137W 1542 nt3.46□□□□□ -1.86
NUP49Q02199 TRX3YCR083W 384 nt3.46□□□□□ -1.86
NUP49Q02199 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.46□□□□□ -1.86
NUP49Q02199 VMA22YHR060W 546 nt3.46□□□□□ -1.86
NUP49Q02199 SPT16YGL207W 3108 nt3.46□□□□□ -1.86
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