Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F1Q01094 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F1Q01094 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms