Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNAQ00169 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms