Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX3P78415 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX3P78415 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX3P78415 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX3P78415 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX3P78415 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX3P78415 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX3P78415 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX3P78415 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX3P78415 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX3P78415 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX3P78415 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX3P78415 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX3P78415 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX3P78415 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX3P78415 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX3P78415 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IRX3P78415 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms