Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 CYM1YDR430C 2970 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 BOI2YER114C 3123 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 ERG25YGR060W 930 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PRM10YJL108C 1152 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YJR096WYJR096W 849 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 LIP2YLR239C 987 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 snR37snR37 386 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PHO12YHR215W 1404 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PHO11YAR071W 1404 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 CNA1YLR433C 1662 nt4.7□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PRP19YLL036C 1512 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TPP1YMR156C 717 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 CPR8YNR028W 927 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 HSP26YBR072W 645 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TDA6YPR157W 1404 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 HOS3YPL116W 2094 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 SAP4YGL229C 2457 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 KGD1YIL125W 3045 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 BOP2YLR267W 1713 nt4.69□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 ENT1YDL161W 1365 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 CPR4YCR069W 957 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 RIP1YEL024W 648 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 RSM26YJR101W 801 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YLR462WYLR462W 609 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YBL094CYBL094C 333 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 AIF1YNR074C 1137 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 Q0255Q0255 1419 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 NUR1YDL089W 1455 nt4.68□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 RVB1YDR190C 1392 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YAP1802YGR241C 1707 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TCM62YBR044C 1719 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 EUG1YDR518W 1554 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YCR050CYCR050C 309 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 BCP1YDR361C 852 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 KEG1YFR042W 603 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 MNN11YJL183W 1269 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YAL066WYAL066W 309 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 SLZ1YNL196C 897 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 SSO1YPL232W 873 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 SUP35YDR172W 2058 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 BDP1YNL039W 1785 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 RGP1YDR137W 1992 nt4.67□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 HSE1YHL002W 1359 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 IDS2YJL146W 1410 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 HNT2YDR305C 654 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PEX14YGL153W 1026 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TIS11YLR136C 858 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YPT53YNL093W 663 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YBL077WYBL077W 432 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 IDI1YPL117C 867 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 APA1YCL050C 966 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 ALG9YNL219C 1668 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TCO89YPL180W 2400 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 PDR10YOR328W 4695 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 TEL1YBL088C 8364 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 DRN1YGR093W 1524 nt4.66□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 APC4YDR118W 1959 nt4.65□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 MET12YPL023C 1974 nt4.65□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 MSN4YKL062W 1893 nt4.65□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 GRC3YLL035W 1899 nt4.65□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 YPL260WYPL260W 1656 nt4.65□□□□□ -1.66
YNL058CP53947 AIM6YDL237W 1173 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 HIM1YDR317W 1245 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 RRP17YDR412W 708 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YFL068WYFL068W 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 VPS29YHR012W 849 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 CSM3YMR048W 954 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 RUF20RUF20 443 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 ELA1YNL230C 1140 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 MED7YOL135C 669 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 HAT1YPL001W 1125 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 ATG14YBR128C 1035 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 RAD28YDR030C 1521 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 HST1YOL068C 1512 nt4.65□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 YOL075CYOL075C 3885 nt4.64□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 RNA14YMR061W 2034 nt4.64□□□□□ -1.67
YNL058CP53947 RPP1AYDL081C 321 nt4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms