Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8P50990 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8P50990 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8P50990 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8P50990 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms