Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK7P50613 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK7P50613 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK7P50613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK7P50613 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK7P50613 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK7P50613 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK7P50613 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK7P50613 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms