Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA3P43357 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAGEA3P43357 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms