Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF5P43026 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF5P43026 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF5P43026 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms